Oct 25, 2023
Сравнительная восприимчивость к ОРВИ
Журнал ISME, том 17,
Журнал ISME, том 17, страницы 549–560 (2023 г.) Процитировать эту статью
3583 Доступа
1 Цитаты
79 Альтметрика
Подробности о метриках
Исследование диких резервуаров патогенных вирусов имеет решающее значение для долгосрочного контроля над ними и прогнозирования сценариев будущих пандемий. Здесь сравнительный анализ инфекций in vitro был впервые проведен на 83 клеточных культурах, полученных от 55 видов млекопитающих, с использованием псевдотипированных вирусов, несущих S-белки SARS-CoV-2, SARS-CoV и MERS-CoV. Было обнаружено, что клеточные культуры подковоносов Томаса, королевских подковоносов, зеленых мартышек и хорьков высокочувствительны к псевдотипическим вирусам SARS-CoV-2, SARS-CoV и MERS-CoV. Более того, пять вариантов (del69-70, D80Y, S98F, T572I и Q675H), которые помимо домена, связывающего шиповый рецептор, могут существенно изменить тропизм SARS-CoV-2 к хозяину. Изучение филогенетических сигналов скорости трансдукции показало, что близкородственные таксоны обычно имеют сходную восприимчивость к MERS-CoV, но не к псевдотипированным вирусам SARS-CoV и SARS-CoV-2. Кроме того, мы обнаружили, что экспрессия 95 генов, например, PZDK1 и APOBEC3, обычно связана со скоростью трансдукции псевдотипированных вирусов SARS-CoV, MERS-CoV и SARS-CoV-2. Это исследование предоставляет базовую документацию о восприимчивости, вариантах и молекулах, которые лежат в основе межвидовой передачи этих коронавирусов.
Коронавирус 2 тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV-2) представляет значительную угрозу общественному здравоохранению и мировой экономике: по состоянию на январь 2023 года во всем мире зарегистрировано более 500 миллионов случаев заражения людей и более 6,6 миллионов смертей. Было высказано предположение, что 2 возник у летучих мышей, а затем перешел к человеческой популяции через промежуточного животного-хозяина [1,2,3]. Хотя вирусы, сходные с SARS-CoV-2, такие как BANAL-20-52, полученные от малайских подковоносов (Rhinolophus malayanus), RaTG13, происходящие от подковоносов промежуточного уровня (Rhinolophus affinis), и Pangolin-CoV, присутствующие у малайских панголинов (Manis avania) [4,5,6], в настоящее время точное животное происхождение SARS-CoV-2 остается неясным. Двумя другими коронавирусами, которые вызывали эпидемии до COVID-19, являются коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV), который, возможно, передался от подковоносов к человеку через инфицированные пальмовые циветты, и коронавирус ближневосточного респираторного синдрома (MERS-CoV), который возможно, передача инфекции от летучих мышей к человеку через инфицированных дромадеров [7,8,9]. Хотя текущая угроза как SARS-CoV, так и MERS-CoV минимальна, мы должны проявлять бдительность в отношении потенциальных рисков распространения вируса на человека из его естественных резервуаров [10, 11].
SARS-CoV-2 способен инфицировать широкий спектр хозяев, включая собак, норок, хорьков, выдр, хомяков, полевок, оленей, оленейных мышей, летучих мышей, мелких и крупных кошек и некоторых приматов, не являющихся людьми [12,13,–14]. ]. Однако сравнить восприимчивость этих видов по-прежнему сложно, поскольку стандартизированные измерения между видами не использовались. В связи с этим в нескольких исследованиях была предсказана вероятность заражения SARS-CoV-2 путем анализа ортологов ангиотензинпревращающего фермента 2 (ACE2). Например, Дамас и др. использовали последовательности ACE2 410 видов позвоночных и обнаружили, что некоторые таксоны, находящиеся под угрозой исчезновения (например, красноногие щуки, хоботные обезьяны, макаки-резусы и антарктические малые полосатики) подвергаются наибольшему риску заражения SARS-CoV-2 [15]. В то же время разрешение кристаллической структуры, анализ поверхностного плазмонного резонанса и молекулярно-динамическое моделирование использовались для оценки аффинности связывания различных ортологов ACE2 с шиповыми белками [15,16,–17]. Хотя эти исследования предоставляют ценную информацию о вероятном диапазоне хозяев SARS-CoV-2, их прогнозы требуют экспериментальной проверки. Более того, в этих прогнозах недооценены эффекты факторов хозяина, отличных от ACE2, связанных с вирусной инвазией [15, 18, 19].